Sexual antagonism, mating systems, and recombination suppression on sex chromosomes
この論文は、人口遺伝学モデルを用いて、性拮抗選択が非常に弱い場合でも性染色体間の組換え抑制の進化を中立進化に比べて劇的に促進し、交尾システムや性決定システム（XY 対 ZW）によってその動態が異なることを示し、さらに抑制因子が異型性染色体ではなく同型性染色体に生じやすい理由を解明したものである。
📄 Category
evolutionary biology
466 件の論文
Direct and indirect benefits of cooperation in collective defense against predation
本論文は、社会性マツノメイガの幼虫が捕食者に対する集団防衛において、直接的・間接的な利益を得る一方で、親族構成や群れの性別比率といった社会的環境に応じて協力度を調整し、フリーライダーの蔓延を防ぐメカニズムを実証的に示したものである。
A phylogenetic protein-coding genome-phenome map of complex traits across 224 primate species.
224 種にわたる霊長類の 263 traits について、進化的な収束や相対進化速度を用いてタンパク質コード領域の変異と複雑な形質を結びつけた初の系統発生学的ゲノム - フェノームマップ（P3GMap）が作成され、食性、免疫、寿命などにおける種特異的な適応や数千の遺伝子 - 形質関連が同定されました。
Epigenetic aging in brain tissue of the self-fertilizing vertebrate, Kryptolebias marmoratus
この研究は、遺伝的変異が極めて少ない自殖脊椎動物であるマングローブ・リビヌス（Kryptolebias marmoratus）を用いて、脳組織の DNA メチル化パターンが遺伝的要因の影響を排除した状態で加齢に伴い一貫して変化することを示し、エピジェネティックな老化と遺伝的効果を分離して理解するための強力なモデル系を確立しました。
Transcriptional Activation of Estrogen Receptor-alpha and Estrogen Receptor-beta from Elephant Shark (Callorhynchus milii)
本論文は、約4億2500万年前に脊椎動物の共通祖先から分岐した軟骨魚類のゾウザメ（Callorhynchus milii）において、ヒトのエストロゲン受容体（ERαおよびERβ）と機能的に保存された3つのエストロゲン応答性受容体遺伝子と1つの非応答性遺伝子を同定し、特にエストロジオール（E2）がすべての受容体で最も低い半最大応答濃度を示すなど、エストロゲンによる転写活性化がヒトと類似していることを明らかにしたものである。
Multiple ecological and evolutionary mechanisms drive treatment-induced antibiotic resistance
この研究は、24,478 株の緑膿菌を解析した結果、シプロフロキサシン耐性の出現が既存の耐性菌の優勢、コストの高い突然変異の選択的掃引、および耐性と増殖のトレードオフに伴う亜集団の振動など、多様で複雑な生態学的・進化的メカニズムによって駆動されることを明らかにし、治療誘発性耐性の予測と管理への示唆を与えた。
HapNet: a new Python package for automated population-aware haplotype network analysis and visualization
HapNet は、アラインメントされた FASTA ファイルから集団メタデータを活用したハプロタイプネットワークの自動構築、可視化、要約を可能にする、再現性と自動化に優れた新しい Python パッケージです。
A classification of structured coalescent processes with migration, conditional on the population pedigree
この論文は、集団の系統（pedigree）を条件付けた構造付き共分岐過程を分類し、従来のモデルが適用できない場合（特に大規模な集団でも遺伝子流動の断続的なパルスが存在するシナリオなど）に系統効果が顕著に現れることを示しています。
Spatial confinement of gene drives: Assessing risk of failure using global sensitivity analysis
この論文は、遺伝子ドライブの空間的閉じ込めにおける失敗リスクを評価するため、確率的空間モデルと大域感度分析を用いて、対象生物の分散やペイロードの適応度コストが遺伝子ドライブの性能に与える影響を定量化し、その空間的挙動を分類する手法を提示しています。
In silico identification and deorphanisation of an allatostatin C GPCR system in the cephalopod Octopus vulgaris reveals two receptors with distinct potency
本論文は、高等な知能を持つイカ（オウムガイ）において、痛覚調節や福祉に関与する可能性のあるアロスタチン C シグナル伝達系を初めて同定・解明し、1 つのペプチドが 2 つの受容体を異なった効力で活性化することを示した。
Environmental perturbation increases gene expression variability and unmasks genetic regulation for transcriptional robustness
この研究は、高糖質食という環境ストレスがショウジョウバエの遺伝子発現変動を増大させる一方で、特定の発達経路ではこれを抑制し、さらに環境依存的な遺伝的調節（veQTL）を露呈させて表現型の頑健性を制御する新たな遺伝的基盤を明らかにしたことを示しています。
Population specific bottlenecks inflated differentiation measures of Louisiana black bear and negate subspecific status
ルイジアナ州のアメリカクロクマ個体群における遺伝的変異は、亜種分化ではなく、範囲拡大に伴う創始者効果やボトルネック、およびミシシッピ川の移動に起因する系統地理的歴史によって説明されるため、本論文は「ルイジアナクロクマ」を亜種として認めることを否定し、保全策を遺伝的多様性の維持と個体数回復の継続に焦点を当てるべきだと結論付けています。
Male-biased sexual selection persists across contrasting habitats in a dioecious plant
この論文は、生息地の劣化（森林と人為的環境）に関わらず、メスよりもオスに強い性的選択が維持され、特に人為的環境では花粉伝達効率に関連するオスの形質に対する選択が強化されることを、雌雄異株植物シレネ・ディオイカを用いた研究から明らかにしたものである。
Rapid speciation in small populations challenges the dominance of ecological speciation
植物のゲノムデータと数理モデルの統合的な分析により、小集団で迅速な種分化が起きる現象は生態的種分化ではなく非生態的なプロセスに起因することを示し、生物多様性の主要な源泉が生態的種分化であるという従来の見解に疑問を投げかけています。
Genetic erosion and projected habitat loss in the protected Alpine moth Actias isabellae galliaegloria (Lepidoptera: Saturniidae)
RAD シーケンシングと生態ニッチモデリングを統合した本研究は、アルプス産の希少種スペイン・ムーンモウ（Actias isabellae galliaegloria）が歴史的なボトルネックによる遺伝的多様性の低下と、気候変動に伴う生息地の縮小という二重の危機に直面しており、保全対策の緊急な必要性を明らかにしました。
Coordinated neural progenitor adaptations drive primate neocortical downscaling
本研究は、マモセットの脳皮質が祖先的な霊長類に比べて小型かつ平滑である現象が、神経前駆細胞の増殖能力低下や早期動態の変化といった協調的な適応によって引き起こされたことを、ヒトおよびマモセットの脳オルガノイドと胎児組織の解析を通じて解明した。
Constrained evolution of a core winter proteome across independently cold-adapted PACMAD grasses
本論文は、PACMAD 亜科のイネ科植物が独立して寒冷環境に適応する過程において、転写レベルではなくタンパク質レベルの応答が強く保存されており、特に LEA3 タンパク質の構造的保存が凍結耐性の鍵となることを示しています。
Dental calculus as a record of Pleistocene reindeer oral, digestive and dietary flora
この論文は、フランスの更新世のトナカイの歯石から古代メタゲノム解析を行い、口腔・消化管微生物叢と食性の遺伝的連続性と変遷を解明し、歯石が絶滅種を含む過去の生態系を復元する強力な手段であることを示したものである。
Assessing positive selection in centromere-associated kinetochore proteins across Metazoan groups.
この研究は、メタゾア多群（寄生バチ、魚類、霊長類）において中心体関連キネトコアタンパク質（コンデンシンI複合体とMis12複合体）の正の選択を評価し、アマゾンモリーでは選択が見られなかったものの、他の群では両複合体のタンパク質に散発的な正の選択の兆候が認められたことを報告している。
Stable but turbulent: the two faces of the germline-restricted chromosome of passerine birds
この論文は、脊椎動物のゲノムにおいて安定な鳥類の核型の中で特異的に急速な進化を遂げる「生殖細胞限定染色体（GRC）」の完全な配列解析を行い、その巨大なサイズ変異や種特異的な反復配列の拡大、そして生殖細胞でのみ維持されるという特殊なメカニズムが、染色体の構造と機能に独特の進化圧力をかけ、種分化や適応進化に重要な役割を果たしていることを明らかにしたものである。